Herramientas Informáticas

Tutorial sobre el uso de PubMed

Tutorial actualizado sobre el uso de esta herramiento vital para búsqueda de información científica.

Autor/a: IntraMed

MEDLINE

MEDLINE® (Medical Literature, Analysis, and Retrieval System Online) es la base de referencia bibliográfica más importante de la U.S. National Library of Medicine's (NLM) que contiene más de 11 millones de referencias a artículos de publicaciones periódicas de todo el mundo en el ámbito de la biomedicina.

Período de tiempo abarcado: indexa citas desde 1966 a la fecha. Fuentes: contempla citas de más de 4300 publicaciones periódicas en 30 idiomas. Cerca del 52% de las mismas fueron originalmente publicadas en U.S.; el 86% tiene como idioma de origen el inglés y el 76% de las citas posee resúmenes escritos por los autores. Actualización: Aproximadamente 8,000 referencias son ingresadas semanalmente a la base (400,000 al año aproximadamente). Cobertura temática: investigación biomédica básica y ciencias clínicas desde 1966 incluyendo enfermería, odontología, veterinaria, farmacia, salud pública, y ciencias pre-clínicas.

PubMed

Con la finalidad de poner información biomédica de alto nivel académico al alcance tanto de profesionales de la salud como del público en general, el gobierno de los Estados Unidos, representado por su Vicepresidente Al Gore, presentó el 26 de Junio de 1997 una nueva interface de acceso gratuito a diferentes bases de datos biomédicas, principalmente al MEDLINE. Esta nueva interface denominada PubMed es un sistema de recuperación de información basado en tecnología de la World Wide Web (WWW), producido por el “National Center for Biotechnology Information (NCBI)” de la National Library of Medicine (NLM). Fue desarrollado inicialmente como la división bibliográfica de un sistema más complejo denominado Entrez, que permite a los usuarios acceder gratuitamente por medio de Internet a diversas bases de datos (bibliográficas y no bibliográficas) entre las que se encuentra el MEDLINE y el PreMEDLINE entre otras.

Ventajas del PubMed

• Acceso gratuito a MEDLINE sin necesidad de registrarse o usar contraseñas para el ingreso.

• Enlace a texto completo de algunos artículos. Algunos de los editores de las revistas indizadas en el MEDLINE participan en el PubMed enviando electrónicamente las citas antes de la fecha de su publicación y si el editor posee un sitio web en donde ofrece una versión completa en “full-text” de dicha publicación, PubMed provee un enlace a dicho sitio así como las referencias de estos artículos en el sitio de publicación tienen enlaces de regreso con PubMed, cerrando de esta manera el círculo de la publicación digital en la Net.

• Cabe destacar que no solamente estos editores pueden vincular partes de sus páginas web a la cita de un artículo en particular del MEDLINE; lo mismo puede ser realizado desde cualquier página web, es muy común ver las referencias de artículos publicados en la Red con los links a la cita del PubMed. Esto le confiere a la actividad científica y de divulgación una versatilidad antes no encontrada y que potencia muchísimo las posibilidades de difusión en Internet de los conocimientos científicos almacenados en la base. Posibilidad de acceder a libros de texto en formato electrónico y sitios web con información editorializada, relacionados con las citas.

• Posibilidad de realizar búsquedas en interfaces especiales para navegar por los diferentes índices del MEDLINE.

• Búsquedas clínicas basadas en filtros metodológicos.

• También encontramos como característica diferencial el concepto de "neighboring" o artículos relacionados ("Related Articles") tanto en la misma base como con otras bases de datos.

El hecho que, al realizar la búsqueda en forma automática lo haga también en el PreMEDLINE, es otro aspecto importante a considerar. El PreMEDLINE es la base de datos en donde se encuentran los artículos que aún no les fueron asignados los términos MeSH u otros parámetros indizadores, la ventaja es que la frecuencia de ingreso de dichos artículos a esta base es diaria (en el MEDLINE es semanal). Provee acceso a revistas NO indizadas en el MEDLINE solamente, por medio de un servicio denominado “PubRef” con el cual se intenta ampliar las características de enlace bibliográfico.

Página de inicio del PubMed

La dirección en la donde encontraremos la homepage de PubMed es:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed

Es altamente recomendable que una vez que haya accedido a la página de inicio del PubMed la guarde en los “Favoritos” o “Bookmarks” según el navegador que disponga (Por ejemplo: Internet Explorer o Netscape Navigator).

Para agregar una página a su lista de páginas favoritas en el Internet Explorer debe:


1-Abrir en el navegador la página de inicio del PubMed.

2-Despliegue la opción “Favoritos” del menú de opciones de la barra de herramientas del navegador, haga clic en “Agregar a Favoritos”.

3-En nueva ventana escriba si lo desea el nuevo nombre para la página y defina la carpeta donde se almacenará el enlace al PubMed.

Realizando búsquedas en PubMed

El sistema PubMed ofrece una variedad de modos de búsqueda para acercarse a las necesidades individuales de los usuarios. Usted puede realizar una búsqueda simple ingresando unos pocos términos en el formulario de la página de inicio o construir una estrategia de búsqueda compleja utilizando los operadores lógicos (también llamados operadores booleanos) o por medio del uso de las opciones provistas en la barra de funciones.

Página de inicio

En la pantalla de inicio del PubMed encontramos, a grandes rasgos, dos áreas claramente definidas (Figura 1):

 


 Figura 1: Página de inicio del PubMed


Area para el ingreso y refinamiento de la búsqueda

Es el area que se encuentra en el centro derecho de la página de inicio y es en donde se halla un casillero de texto donde se deben ingresar los términos a buscar. También encontramos enlaces para optar por otras bases, portapapeles, historial, índice y vista previa, límites y otras opciones que aparecen en las páginas que se muestran los resultados obtenidos en una búsqueda.

Area para acceder a servicios especiales

Es la porción de la izquierda en azul que siempre acompañará al usuario en las diferentes instancias de búsqueda y cambiará las opciones según el lugar donde se encuentre. En la página de inicio permite acceder a servicios tales como la Ayuda del PubMed, un Tutorial interactivo, el MeSH Browser, el Journal Browser, el Citation Matcher, los Clinical Queries, etc.

Reglas para el ingreso de términos

Se pueden ingresar uno o más términos en el casillero de texto y luego presionar la tecla Enter de su computadora u oprimir el botón “SEARCH” a la derecha del casillero.
Existen determinadas reglas a ser tenidas en cuenta con respecto a la forma en la cual los términos deben ser ingresados en el casillero de texto, las cuales son comentadas a continuación:

Términos de Búsqueda: ingrese uno o más términos de búsqueda (separar los términos por espacios) en el casillero de texto. Luego de presionar el botón SEARCH o la tecla Enter PubMed compara los términos ingresados con una serie de tablas (Véase Mapeo Automático de Términos) y luego automáticamente combina los términos agregando el operador lógico de intersección AND.

Nombres de Autores: para realizar la búsqueda de citas por el nombre del autor, el mismo deberá ser ingresado con el apellido separado por un espacio de las iniciales del o los nombres sin signos de puntuación. Por ejemplo: cheja d (las iniciales son opcionales). Mediante el ingreso del formato antedicho (apellido + iniciales) el término es buscado en el campo de Autor del MEDLINE [AU], en principio PubMed automáticamente trunca (véase Truncación de palabras) el nombre del autor para toda la variedad de iniciales. Si solamente se ingresa el apellido del autor, PubMed realizará la búsqueda de ese nombre en todos los campos [All Fields] y no solamente en el de Autor.

Títulos de Journals o revistas: los títulos o nombres de las revistas pueden ingresarse:
Completos: por ejemplo New England Journal of Medicine Abreviados según el MEDLINE: N Engl J Med Números del International Standard Serial Number (ISSN): 00284793

Si el nombre de la revista es igual a algún término MeSH, por ejemplo Gene Therapy, Science o Cell, PubMed buscará el término como MeSH y como texto libre y no como nombre de publicación. Para evitar lo antedicho habría que agregar el nombre del campo, por ejemplo Science [TA], con lo cual si será buscado en para evitar que sea buscado en todos los campos existentes. El número de ISSN no es recomendado para las citas antiguas. 
 
Realizando la primera búsqueda

Una vez definidos el o los términos que mejor representan lo que deseamos buscar deben ser escritos en el casillero de texto. Para ilustrar los pasos correspondientes a una búsqueda desde la página de inicio del PubMed utilizaremos la estrategia necesaria para encontrar citas que versen sobre el tratamiento farmacológico del asma en niños.

En primer lugar se debe abstraer de la sentencia previa los términos que mejor la representan y escribirlas correctamente. Para ello es fundamental aprender a usar una de las interfaces especiales del PubMed, el MeSH Browser, ya que así nos aseguraremos de no cometer errores ortográficos al ingresar los términos en el casillero de texto.

Con respecto a nuestro ejemplo los términos que conforman nuestra primera estrategia de búsqueda son: drug therapy asthma children los cuales deberán ser escritos en el casillero de texto separados por espacios tal como se ve en la Figura 2, luego se debe oprimir la tecla Enter o el botón Go a la derecha del casillero de texto.

Inmediatamente después de haber apretado el botón SEARCH, la próxima pantalla que aparece es la Página de Resultados donde veremos las citas recuperadas de la base con la estrategia utilizada (Figura 3). Más adelante se describe en detalle dicha página. 
 

Figura 3: Página de resultados



→ Para acceder al artículo completo en formato PDF, haga clic aqui